2010/03/02 (Tue) Rパッケージのインストール

LinuxだとRのGUI版がないから、コマンドラインからRを起動する。GUIだとパッケージのインストールはメニューから行えて直感的だが、コマンドでやるには当然ながらコマンドを知っておく必要がある。

まずはRを起動。ターミナルで
    $ R
でOK.  Windowsのコマンドプロンプトと違って、大文字・小文字の区別があるのでちょっと戸惑った。

パッケージをインストールするにはR上で
  > install.packages("xxx")
xxxはインストールしたいパッケージ名を適宜入力する。その後ダウンロード先を適当に選ぶと、インストールが完了する。CRANに登録されているものならインストールできる。

その他に、まずファイルを手動でダウンロードしてきて、Rを開かずにターミナルで
    $ sudo R CMD INSTALL ファイル名
とする手もあるらしい。手間を考えると上の方法の方が楽かな。
ちなみに、インストールされたパッケージはHomeディレクトリのRというフォルダに保存されるようだ。ここへは一般のパスは通っていないが、おそらくRからの探索パスには入っているんだろう。

今日は、もしかしたらMarkov Chain Monte Carloに手を出すかもしれないので、MCMCpackというパッケージをインストールした。